Ứng dụng công cụ AI trong nghiên cứu khoa học

 1.  Tạo khung cấu trúc chặt chẽ cho phần tổng quan

-     Claude sonnet 3.5

-     Scispace (typeset.io): literature review

2.  Tìm số liệu cho phần tổng quan/ đặt vấn đề

-     Elicit: tự động trích xuất dữ liệu thành bảng so sánh (cỡ mẫu, tỷ lệ, địa điểm nghiên cứu, thời gian…).

       Nguồn: Semantic Scholar API (hơn 200 triệu bài báo học thuật, bao gồm toàn bộ PubMed, Medline, IEEE, Springer, Elsevier, Wiley).

-     Consensus: trả lời câu hỏi dạng có/không dựa trên bằng chứng thực tế.

       Nguồn: Semantic Scholar + PubMed Central (PMC).

-     Perplexity (Scholar mode): Tìm số liệu thô.

       Semantic Scholar API + Công cụ quét Web thời gian thực. Kết hợp được cả bài báo học thuật lẫn các báo cáo số liệu dịch tễ mới nhất của các tổ chức y tế thế giới chưa kịp in thành bài báo.

-   Connected Papers

3.  Biên tập tài liệu

-     Gemini NotebookLM 1.5 Pro cho phép nạp toàn bộ các tài liệu vào bao gồm:

+     Elicit: Export ma trận tài liệu Elicit file CSV

+     Perplexity: Copy toàn bộ số liệu dịch tễ kèm link/ mã trích dẫn

+     Consensus: file word kết quả đồng thuận

+     Các tài liệu PDF toàn văn quan trọng

+     File khung nội dung “Chỉ dẫn mục tiêu”/Form mẫu: Context, Role, Task, Output, Require.

 Ra lệnh: “Tại mỗi mục nhỏ trong khung, hãy chỉ rõ: Con số thống kê cụ thể nào, của tác giả nào trong nguồn tài liệu cần được đưa vào (Gắn kèm tên tài liệu nguồn làm minh chứng). Chỉ rõ các khoảng trống nghiên cứu (Research gaps) hoặc các điểm mâu thuẫn giữa các nghiên cứu được ghi nhận trong tài liệu để tôi nhấn mạnh. Tuyệt đối không tự bịa ra thông tin, số liệu hoặc tên tác giả nằm ngoài các nguồn tôi đã nạp.”

  Lên khung nội dung chi tiết

-     Claude 3.5 Sonnet: Viết văn phong tự nhiên

Hỏi: vậy làm sao kết hợp elicit, gemini, consensus và cuối cùng đưa cho claude viết?

4.  Phân tích số liệu và viết code R

-     Excel Copilot: làm sạch số liệu như phát hiện giá trị trống, chuẩn hoá định dạng ngày tháng, mã hoá biến số

-     Julius AI: tải file số liệu thô Excel lên để phân tích số liệu, mô hình hồi quy, vẽ biểu đồ Kaplen-Meier… Dùng để thăm dò nhanh dữ liệu trước khi chốt mô hình chính thức.

-     Claude Artifacts: Đưa cấu trúc các biến số vào cho Claude, yêu cầu viết, tối ưu hoá và sửa lỗi mã R Copy về Rstudio để thực thi

-     Vẽ biểu đồ: Cài package R-esquisse

5.  Viết bản thảo

-     Claude: viết phần kết quả và thảo luận

-     Scite.ai: quét bài báo tránh trích dẫn nhầm các nghiên cứu đã bị rút

-   Paperpal

-   Writefull

6.  Làm slide

-     Gamma App: Copy dàn ý chi tiết vào  AI tự chia bố cục, tạo slide, phối màu, chèn minh hoạ sau đó xuất file PPT để chỉnh sửa tiếp

-     Beautiful.ai: Mạnh về biểu đồ, bảng biểu

7.  Tạo chatbot khám chữa bệnh lâm sàng

-     OpenAI Custom GPTs/ Dify.ai (Mô hình RAG – Dữ liệu nội bộ): Upload các tài liệu lên làm nguồn cho AI. Tốn phí.

Nhận xét

Đăng nhận xét

Bài đăng phổ biến từ blog này

Một số vấn đề lưu ý về phê duyệt đạo đức trong nghiên cứu y sinh học (IEC/IRB)

Văn bản chuyên môn và pháp lý Bộ Y tế (2013). Hướng dẫn quốc gia về đạo đức trong nghiên cứu y sinh học. Ban đánh giá các vấn đề đạo đức trong nghiên cứu y sinh học. A. MỘT SỐ THUẬT NGỮ VÀ KHÁI NIỆM 1. IEC: Independent Ethics Committee  - Hội đồng đạo đức độc lập = Hội đồng đạo đức trong nghiên cứu y sinh học cấp Bộ = Ban đánh giá các vấn đề đạo đức trong nghiên cứu y sinh học Bộ Y tế. Phạm vi thẩm quyền của IEC theo quy định tại Điều 4 Quyết định 111/QĐ-BYT ngày 11/01/2013. Cụ thể (trang 106): - Đề tài, dự án cấp Bộ. - Đề tài nghiên cứu hợp tác quốc tế. - Nghiên cứu TNLS thuốc, trang thiết bị y tế. - Nghiên cứu ứng dụng các kỹ thuật mới, phương pháp mới, công nghệ mới lần đầu tiên trên người tại Việt Nam. Đối với các trường hợp trên, IRB xem xét, đánh giá về đạo đức trong nghiên cứu trước khi trình hồ sơ nghiên cứu để được xem xét, thẩm định tại IEC. 2. IRB: Institutional Review Board = Hội đồng đạo đức trong nghiên cứu y sinh học cấp cơ sở. Phạm vi thẩm quyền: đề tài nghiên...
Read more »

PCE - Parasite clearance estimator (K, slope half-life, PCx)

Hình ảnh
MỘT SỐ KHÁI NIỆM CẦN NẮM 1. Diễn tiến làm sạch ký sinh trùng trong giai đoạn đầu: "Lag phase - First order process - Tail" Lag phase: có thể do age distribution của quần thể KST. Ban đầu tại thời điểm dùng thuốc, nếu có nhiều KSTSR thể phân liệt (schizont), vài giờ sau đó, thể phân liệt này vỡ và các mảnh trùng lại xâm nhập vào hồng cầu mới, dẫn đến mật độ KST chưa giảm ngay (hoặc tăng) sau khi dùng thuốc. Mật độ KST tại thời điểm t trong First order process:  P t =P 0  exp(-K × t) Thường có mối liên quan tuyến tính. P0: initial parasitemia; K: clearance rate constant: t: time point. Tail: parasitemia remains close to detection limit and does not increase over a number of time-points. Tails are not observed in all profiles. 2. Clearance rate constant (Hằng số "tỷ suất" làm sạch ký sinh trùng): K. 3. Slope half life ( T 1/2 ): khoảng thời gian để mật độ KST giảm đi một nửa (in first order process), đây là chỉ số cố định, được xác định sau khi loại bỏ lag phase và tai...
Read more »

Xét nghiệm thiếu hoạt độ Glucose-6-Phosphate Dehydrogenase (G6PD)

Hình ảnh
Theo Tổ chức Y tế thế giới [5], có thể phân loại các xét nghiệm đánh giá hoạt độ G6PD như sau: - Genetic assays (xét nghiệm kiểu gen): gồm PCR và giải trình tự gen (DNA sequencing), ứng dụng trong các nghiên cứu cộng đồng , điều tra tỷ lệ thiếu hoạt độ G6PD; - Phenotype assays (xét nghiệm kiểu hình): ứng dụng trong đánh giá hoạt độ G6PD ở cấp độ cá nhân trong thực hành lâm sàng. Gồm 3 nhóm nhỏ: (I) các xét nghiệm định tính, (II) các xét nghiệm định lượng, và (III) xét nghiệm hóa học tế bào. A. XÉT NGHIỆM PHÂN TỬ (GENETIC ASSAYS) Xét nghiệm sinh học phân tử có thể phát hiện các đột biến trên gen G6PD gây tình trạng thiếu hoạt độ enzyme. Khác với các phương pháp khác phải thực hiện ngay sau khi lấy máu, mẫu bệnh phẩm xét nghiệm sinh học phân tử có thể được lưu giữ để thực hiện sau, ví dụ như phân tích giọt máu giấy thấm. Ứng dụng:      + Các nghiên cứu trên cộng đồng để xác định tỷ lệ thiếu hoạt độ G6PD. Vì tỷ lệ thiếu hoạt độ G6PD có thể dao động lớn giữa các vùng khác n...
Read more »