Phân biệt nhanh các kỹ thuật xét nghiệm PCR

- PCR truyền thống (conventional PCR): khuếch đại và phát hiện đoạn DNA.

- PCR sao chép ngược (RT-PCR, reverse transcriptase PCR): sử dụng enzyme phiên giải ngược để chuyển mRNA thành DNA trước khi thực hiện PCR; do đó phát hiện RNA.

- PCR thời gian thực (qPCR, realtime PCR): cho phép theo dõi quá trình phản ứng chuỗi DNA theo thời gian thực (từng vòng phản ứng).

- PCR lồng ghép (nested PCR): hai phản ứng chuỗi khác nhau được thực hiện liên tiếp trên cùng một mẫu DNA với cặp mồi khác nhau cho từng phản ứng.

- PCR đa mồi (multiplex PCR): cho phép khuếch đại nhiều trình tự DNA chỉ trong một phản ứng PCR.

Nhận xét

Đăng nhận xét

Bài đăng phổ biến từ blog này

Một số vấn đề lưu ý về phê duyệt đạo đức trong nghiên cứu y sinh học (IEC/IRB)

Văn bản chuyên môn và pháp lý Bộ Y tế (2013). Hướng dẫn quốc gia về đạo đức trong nghiên cứu y sinh học. Ban đánh giá các vấn đề đạo đức trong nghiên cứu y sinh học. A. MỘT SỐ THUẬT NGỮ VÀ KHÁI NIỆM 1. IEC: Independent Ethics Committee  - Hội đồng đạo đức độc lập = Hội đồng đạo đức trong nghiên cứu y sinh học cấp Bộ = Ban đánh giá các vấn đề đạo đức trong nghiên cứu y sinh học Bộ Y tế. Phạm vi thẩm quyền của IEC theo quy định tại Điều 4 Quyết định 111/QĐ-BYT ngày 11/01/2013. Cụ thể (trang 106): - Đề tài, dự án cấp Bộ. - Đề tài nghiên cứu hợp tác quốc tế. - Nghiên cứu TNLS thuốc, trang thiết bị y tế. - Nghiên cứu ứng dụng các kỹ thuật mới, phương pháp mới, công nghệ mới lần đầu tiên trên người tại Việt Nam. Đối với các trường hợp trên, IRB xem xét, đánh giá về đạo đức trong nghiên cứu trước khi trình hồ sơ nghiên cứu để được xem xét, thẩm định tại IEC. 2. IRB: Institutional Review Board = Hội đồng đạo đức trong nghiên cứu y sinh học cấp cơ sở. Phạm vi thẩm quyền: đề tài nghiên...
Read more »

PCE - Parasite clearance estimator (K, slope half-life, PCx)

Hình ảnh
MỘT SỐ KHÁI NIỆM CẦN NẮM 1. Diễn tiến làm sạch ký sinh trùng trong giai đoạn đầu: "Lag phase - First order process - Tail" Lag phase: có thể do age distribution của quần thể KST. Ban đầu tại thời điểm dùng thuốc, nếu có nhiều KSTSR thể phân liệt (schizont), vài giờ sau đó, thể phân liệt này vỡ và các mảnh trùng lại xâm nhập vào hồng cầu mới, dẫn đến mật độ KST chưa giảm ngay (hoặc tăng) sau khi dùng thuốc. Mật độ KST tại thời điểm t trong First order process:  P t =P 0  exp(-K × t) Thường có mối liên quan tuyến tính. P0: initial parasitemia; K: clearance rate constant: t: time point. Tail: parasitemia remains close to detection limit and does not increase over a number of time-points. Tails are not observed in all profiles. 2. Clearance rate constant (Hằng số "tỷ suất" làm sạch ký sinh trùng): K. 3. Slope half life ( T 1/2 ): khoảng thời gian để mật độ KST giảm đi một nửa (in first order process), đây là chỉ số cố định, được xác định sau khi loại bỏ lag phase và tai...
Read more »

Xét nghiệm thiếu hoạt độ Glucose-6-Phosphate Dehydrogenase (G6PD)

Hình ảnh
Theo Tổ chức Y tế thế giới [5], có thể phân loại các xét nghiệm đánh giá hoạt độ G6PD như sau: - Genetic assays (xét nghiệm kiểu gen): gồm PCR và giải trình tự gen (DNA sequencing), ứng dụng trong các nghiên cứu cộng đồng , điều tra tỷ lệ thiếu hoạt độ G6PD; - Phenotype assays (xét nghiệm kiểu hình): ứng dụng trong đánh giá hoạt độ G6PD ở cấp độ cá nhân trong thực hành lâm sàng. Gồm 3 nhóm nhỏ: (I) các xét nghiệm định tính, (II) các xét nghiệm định lượng, và (III) xét nghiệm hóa học tế bào. A. XÉT NGHIỆM PHÂN TỬ (GENETIC ASSAYS) Xét nghiệm sinh học phân tử có thể phát hiện các đột biến trên gen G6PD gây tình trạng thiếu hoạt độ enzyme. Khác với các phương pháp khác phải thực hiện ngay sau khi lấy máu, mẫu bệnh phẩm xét nghiệm sinh học phân tử có thể được lưu giữ để thực hiện sau, ví dụ như phân tích giọt máu giấy thấm. Ứng dụng:      + Các nghiên cứu trên cộng đồng để xác định tỷ lệ thiếu hoạt độ G6PD. Vì tỷ lệ thiếu hoạt độ G6PD có thể dao động lớn giữa các vùng khác n...
Read more »